Si vous avez pas mal de comptes sur Thunderbird (ou des paramétrages plus ou moins compliqué) alors je vous invite à utiliser :
Le logiciel Mozbackup !
Celui-ci vous permettra de sauvegarder tous vos paramètres de comptes Thunderbird, notamment avec une option de protection par mot de passe. Il propose également cette fonctionnalité pour Firefox. Attention toutefois la taille de la sauvegarde peut être importante suivant ce qui est stocké.